Sciences de la Vie

ASM Journals Online
Base de données bibliographiques éditées par l’American Society for Microbiology (ASM). Site de l’éditeur ASM ; dépouille ses revues. Attention, c’est la recherche bibliographique qui est gratuite, pas les revues.

BioRxiv
Archive ouverte éditée par le Cold Spring Harbor Laboratory, sur le modèle d’ArXiv, dans le domaine des sciences de la vie. Ce réservoir n’accueille que des prépublications, validés par des chercheurs avant leur mise en ligne.

BMCD – Biological Macromolecule Crystallization Database and the NASA Archive for Protein Crystal Growth Data
Base de données factuelles et bibliographiques éditées par le National Institute of Standards and Technology and Department of Commerce (Etats-Unis). Contenu : analyse cristallographique des éléments ; biochimie et cristallographie ; avec quelques références d’articles.

Brenda
Base de données sur les enzymes éditée par l’Institut de Biochimie de l’Université de Cologne (Allemagne). Une fois les informations trouvées, Brenda propose en complément un lien vers les articles recensés par PubMed et traitant de l’enzyme sur lequel on a fait une recherche.

CAZy – Carbohydrate-Active en ZYmes
Base de données éditée par le Goupe AFMB (Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques) du CNRS. Contenu : description des enzymes faisant réagir les liens glycosidiques ; CAZy propose également des liens vers les données génétiques de la GenBank (interface PubMed) ainsi qu’un lien vers les arcticles recensés par PubMed traitant de l’enzyme recherchée.

Clemam
Base de données factuelles et bibliographiques : taxons des mollusques marins, ainsi que références bibliographiques sur ces animaux.

Compendium of Pesticide Common Names
Base de données consacrée aux pesticides : noms de pesticides conformes à la norme ISO, avec leur formule et leur structure.

DNA Data Bank of Japan
Base de donnée, base de données factuelles éditée par le National Institute of Genetics (Japon) : base de séquences génétiques

Elsevier ScienceDirect
Site de l’éditeur Elsevier ; dépouille ses revues ; attention, c’est la recherche bibliographique qui est gratuite, pas les revues.

EMBL Nucleotide sequence Database
Base de données éditée par l’EBI (organisation membre du European Molecular Biology Laboratory EMBL) : base de séquences génétiques.

Environmental Fate Data Base
Base de données éditée par la Syracuse Research Corporation : plusieurs bases en biochimie de l’environnement proposant les propriétés des produits avec quelques références bibliographiques : Datalog (environnement), Biolog (toxicité microbienne et biodégradation), Chemfate (composés importants dans le commerce), Biodeg (biodégradation), Biodeg Summary (méthodes expérimentales ; expériences sur la biodégradation avec ou sans oxygène).

GenBank
Base de données éditée par le Pittsburgh Supercomputing Center (PSC), Carnegie Mellon University, University of Pittsburgh (Etats-Unis) : base de séquences génétiques.

Kegg Ligand database
Base de données éditée par l’Institute for chemical research, Kyoto University (Japon) : formules et réactions ; formules de médicaments.

MEROPS – the Peptidase Database
Base de données éditée par le Medical Research Council (organisme public britannique) et Wellcome Trust (fondation de recherche) : données sur les peptidases dans les gènes d’humains ou de souris ; nombreux liens vers les notices de peptidases dans d’autres bases de données : UniProt (protéines), Gencards (génétique), PubMed (ses parties Gene et OMIM sur la génétique humaine), Ensembl (génétique), données du Galton Laboratory de l’University College London (génétique humaine).

National Sea Grant Library (NSGL)
Base de données bibliographiques éditée par la National Sea Grant Library (University of Rhode-Island) : références bibliographiques en vie marine et vie des grands lacs ; avec parfois le texte intégral en pdf.

PDB – Protein Data Bank
Base de données factuelles et bibliographiques éditée par le Research Collaboratory for Structural Bioinformatics. Contenu : caractéristiques de protéines, avec également les références de l’article dans lequel les chercheurs ont décrit cette protéine avant d’en déposer la description dans la PDB.

Pherobase : database of insect pheromones ans semiochemicals
Base de données bibliographiques sur les hormones d’insectes.

PubMed
Base de données bibliographiques éditée par la National Library of Medicine (Etats-Unis). Version gratuite de la base bibliographique Medline ; de 1967 à nos jours, références d’articles en biochimie, biologie, médecine clinique, éthique, odontologie, pharmacologie, psychiatrie, santé publique, toxicologie, médecine vétérinaire.

Semences biologiques
Base de données factuelles éditée par le GNIS (Groupement National Interprofessionnel des Semences et plants) pour le compte du Ministère de l’Agriculture. Base recensant les variétés de semences et de plants disponibles, avec leurs fournisseurs.

Toxnet
Base de données factuelles et bibliographiques éditée par la National Library of Medicine (Etats-Unis). Permet d’interroger simultanément les bases de données descriptives et bibliographiques en toxicologie et environnement suivantes : ChemIDplus, HSDB, Toxline, CCRIS, DART, GENETOX, IRIS, ITER, LactMed, TRI, Haz-Map, Household Products, Toxmap.